本发明根据同源基因序列的相对保守性，查找与拟南芥抗病基因cDNA同源的棉花EST片段，将部分重叠且高度同源的棉花EST进行序列拼装，组合成完整ORF的cDNA序列，根据这些序列设计特异性的PCR引物，采用RT-PCR的方法，获得GhEDR2基因。利用qPCR分析发现该基因在棉花植株中的表达呈现了组织特异性的特点。而且转基因植物黄萎病的发病率明显低于非转基因植物。因此利用本发明所述的GhEDR2基因来培育抗黄萎病植物，在植物抗病育种中将会有广阔的前景。