中熟棉遗传育种创新团队2018年被认定为院优势课题组。团队围绕棉花学科发展趋势和产业的需求，针对拓宽育种遗传基础与高效创造新种质研究中的关键科学问题，面向黄河流域中熟和中早熟棉区，辐射南疆中熟棉区，开展棉花遗传育种领域的种质创新、技术创新、品种创新和理论创新工作，加快育种技术的应用，加速新品种的转化为现实生产力。近期规划：筛选抗逆、优质、适宜轻简化的棉花育种材料和亲本；利用昆虫传粉简化三系杂交棉制种技术。通过育种技术手段，解决棉花生产品质差、抗逆性不强、机械化程度低、种植收益下降等问题。中长期规划：利用基因编辑、分子设计育种等现代手段实现棉花育种材料及技术升级，培育优质高产适于机械化的棉花新品种（杂交种）；实现杂交棉制种技术突破；建立新疆棉花育种基地。

团队现有研究人员9名，其中研究员1人，副研究员4人，助研3人，研实1人。学历分布上，博士1人，硕士3人，本科5人。在棉花耐旱育种技术体系、三系杂交棉的选育技术、棉花多性状聚合育种等方面取得一些研究成果，形成鲜明的特色和优势。近十年育成的晋棉系列品种广泛应用于生产，服务晋南乃至黄河流域和南疆棉区，累计推广面积500余万亩，获得广泛的好评。

2008年以来，团队共承担各级各类项目29项，其中国家级项目6项，省级项目10项，院级项目13项。获得山西省科技进步二等奖1项，三等奖1项，省农村技术承包二等奖1项。审（认）定6个棉花新品种。发表论文28篇，其中SCI收录1篇，核心期刊论文10篇。制定山西省地方标准3项。授权发明专利4项，实用新型专利9项。