本文以高抗黄萎病海岛棉材料长312为试材，利用蛋白质双向凝胶电泳和质谱鉴定技术探讨棉花在大丽轮枝菌胁迫下蛋白质水平的变化。在接种大丽轮枝菌2h后，发现长312叶片中有11个蛋白表达水平下调，15个蛋白表达水平上调，下调表达的蛋白主要是与光合作用及碳同化相关的一些酶类；上调的蛋白主要是一些与光合作用、碳同化相关的酶类及苯醌还原酶、β-D-半乳糖苷酶、14-3-3f蛋白等抗病蛋白。推测海岛棉对黄萎病的防御机制发生在2个层面：一是被动防御，可能通过叶绿体ⅡA-B结合蛋白、核酮糖二磷酸羧化酶等下调蛋白的同工蛋白上调表达保持抗病海岛棉光合系统的稳定，通过组蛋白和14-3-3f蛋白的高表达保持抗病海岛棉植株细胞的稳定性；二是主动防御：可能通过高表达β-D-半乳糖苷酶和苯醌还原酶等参与海岛棉的抗病反应。